Средне образовательная школа № 9 города Аткарска, занимает одно из красивейших зданий в городе, здание бывшей гимназии построеное в 1903 году, при главе города Ф. Н. Павлюкове. Массивную двухэтажную постройку из красного кирпича 1 июля 1904 года заняла женская гимназия. В 1907–1915 годах в здании размещалось начальное мужское училище, после чего оно служило военным и медицинским нуждам в перипетиях Первой мировой и гражданской войн и вплоть до 1932 года, когда в него въехала новая семилетняя школа. В 1937 году она стала железнодорожной, 9-й номер получила в 1953 году. В 1964 году к зданию была сделана пристройка.
С 1997 года школа находится в ведении города и является средней общеобразовательной. В 1998 году при школе был образован лицей полупроводниковой электроники СГУ. В 1922-1929 годах в школе учился будущий Народный артист СССР, актёр Борис Андреев. В феврале 2015 года на здании средней школы № 9 состоялось открытие мемориальной доски Борису Федоровичу Андрееву, приуроченное к 100-летию со дня рождения великого советского актера театра и кино. Борис Андреев снялся в 56 советских фильмах, многие из которых стали знаковыми. Играл в театре, озвучивал мультипликационные и документальные фильмы. За многолетний труд Борис Федорович удостоен двух Сталинских премий. Ранее местный кинотеатр "Родина" был переименован в Культурно-просветительский центр досуга и кино им. Б. Ф. Андреева.
С момента постройки здание действовало как учебное заведение, первоначально, с 1 июля 1904 года, как Аткарская женская гимназия, содержалась женская гимназия государственным казначейством, городским обществом и специальными средствами. Позже с 1907 года по 1915 год в здании 9 школы находится начальное мужское училище. Оно размещалось в пристройке основного здания. После постройки здания для женской гимназии на Торговой площади в 9 школе находится только начальное мужское училище. В период русско-германской войны (1915-1917)в здании помещалась учебная команда полка. Когда началась гражданская война, появились раненые, то в здании школы разместили эвакогоспиталь (1920-1921), а потом до 1932 года была больница. С 1932 в здании разместили семилетнюю школу.
В годы войны в школе размещался один из госпиталей. В 1934 году школе было присвоено звание образцовой школы №1. В 1937 году школа была передана в ведение Рязано- Уральской железной дороги и переименована в неполную школу РУЖД, с 1938 года школа стала средней. С 1941 по 1945 годы в здании школы был размещен госпиталь, а учащиеся занимались в здании школы № 8.
В 1953 году начальник Приволжской Железной Дороги издал приказ: "об установлении нумерации учебных заведений Приволжской ЖД: установит следующую нумерацию по школам: №9, станция Аткарск". В 1964 году построена пристройка к зданию школы. с 1975 по 1992 гг. школу возглавляла отличник просвещения Орлова Лидия Александровна.
С 1992 года школу возглавляет Заслуженный Учитель РФ, отличник просвещения, почетный железнодорожник Жилкина Фаина Сергеевна.
С 1997 года школа была передана в ведение управления общего образования города Аткарска и стала именоваться «Муниципальное общеобразовательное учреждение средняя общеобразовательная школа № 9 города Аткарска Саратовской области».